植物百合病虫害主要有：灰霉病、脚腐病、炭疽病、病毒病、青霉菌、腐霉菌、蚜虫等。其中，蚜虫是一种比较常见的虫害，发病以后，它会使百合的叶片卷曲畸形，严重时会危害整个植株生长。而百合灰霉病也比较常见，它的发病时间通常是在五月下旬到六月下旬之间，如果遇到连续的降雨时，就会加重病情。
