一般在内蒙古五原县产的南瓜籽是最好吃的，具有颗粒大而饱满和味道油香的特点，另外在中国东北产的南瓜籽是最好的，具有纯度高、出仁率高的特点。南瓜籽属于种子部分，并不是果实，一般在10月份后成熟，常见的产地在内蒙古、浙江、江苏、东北、河北、山东和山西等地方。
南瓜籽最好吃的吃法就是在烤熟后食用，这时的南瓜籽味道是最醇香的，另外南瓜籽和白糖、花生和蜂蜜一起搭配是最好吃的，也具有很好的养生疗效。
